Python 技术交流群:快速掌握 HDF5 文件操作,让数据存储读取不再困难

HDF5文档以其高效性和被广泛使用广泛受到好评。它优越的读写性能以及能将数据精细划分并储存到类似抽屉结构中的特点使得它备受认可。Python编程界常用两个策略来巧妙应用这个强大的工具。今日,让我们一同深入探讨HDF5文档的独特性质及其引人入胜的魅力。

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HDF5文件的魅力

诚然,事实证明,HDF5文件格式在高效存储方面表现出色。相较于处理大数据集时犹如缓慢爬行的蜗牛般的CSV文件,HDF5能显著提高数据传输效率。更值得关注的是,该协议不仅提升了存储速度,而且通过明确的层次结构对数据进行有序管理,使其组织得如同图书馆藏书般有条不紊。

import pandas as pd

store = pd.HDFStore('demo.h5')
'''查看store类型'''
print(store)

HDF5文件以其完整集成数据存储功能及广泛适应各类数据类型(含图像、文本及数值)的特质,在数据科学与工程等领域备受青睐。

import numpy as np

#创建一个series对象
s = pd.Series(np.random.randn(5), index=['a''b''c''d''e'])
s

利用pandas操作HDF5文件

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处理HDF5项目,Pandas是Python首选工具。借助其提供的丰富的HDF5函数功能,可满足将Pandas数据结构直接存储于HDF5文件中的需求。

#创建一个dataframe对象
df = pd.DataFrame(np.random.randn(83),
                 columns=['A''B''C'])
df

在Pandas中,可借助HDFStore()函数构建实现HDF5文件I/O功能的实用工具。该工具有两个关键参数,分别是’path’和’mode’。前者指明待处理HDF5文件的完整路径名,后者决定了文件的读写权限。此参数的配置与Python内建的open()函数完全相同。默认设置为’a’,表示若文件已存在,新写入的数据将覆盖原有的;反之,若不存在,则会自动创建新的文件。

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HDFStore()的神奇功能

store['s'], store['df'] = s, df

理解HDFStore的功能,不仅需要关注它作为文档管理助手的功能,更需深入洞察其多样化的运作原理。首先,通过采用dataframe模式,数据得以方便地以数据帧形式存储;其次,借助store对象,用户可轻松完成数据追加及数据帧查询等复杂操作,使得整个过程如同操作数据库文件一般便捷。

store.put(key='s', value=s);store.put(key='df', value=df)

通过使用HDFStore()函数,我们可以迅速索引并访问指定键名称的数据。同时,在去除存储中的某些数据时,有两种方式供您选择:分别是利用remove()方法携带相应键值进行操作,或者采用del命令来实现数据的彻底删除。这些便捷的特性使得HDFStore()成为了高效管理HDF5格式文件的得力助手。

store.items

持久化存储与数据读取

在成功处理完HDF5文件之后,为实现本地持久化存储的目标,只需简单调用close()函数即可实现关闭操作,从而稳妥、可靠地将数据保存至用户设备之中。

除直接运用store对象外,还可将Pandas数据架构存入本地h5档案进行管理。在访问HDF5文档时,通常有两种方式:一为利用IO对象链接至本地h5文件后,借助键索引或store对象的get()功能获取所需信息;二为借助Pandas的read_hdf()函数,该函数需提供以下主要参数:

store['df']

读取速度的对比

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在此篇文章中,我们将针对HDF5与CSV这两种数据存储方式在读取同一组大数据集时所表现出的效率差异展开深入分析。首先,我们构建了一个包含高达一百万行、五列均为浮点型正态随机数的大规模数据矩阵。然后,借助Python编程环境下的Pandas库,采用HDF5以及CSV两种不同形式的文件格式来实现这些数据的持久性存储。

采用HDF5机制绘表,相较于传统CSV方式可提高约50倍的速率。无论数据规模如何,二者存储文件体积亦有显著区别。鉴于此,面对大规模数据环境,HDF5体现出卓越的性能优势。

store.remove('s')

总结与思考

深入分析HDF5文件的诸多优势,包括其卓越的数据存储和访问性能,证实了该文件格式操作便捷,结构复杂多样却易学易用,适用于各类用户群体,无论是深谙技术的专家学者还是初涉计算机领域的新手,皆可从其中受益匪浅。

del store['s']

在面对庞大数据处理难题时,是否曾经考虑运用HDF5文件提高工作效能呢?欢迎积极分享宝贵见解于评论区。同时,若认同本文论述之价值,请顺手点个赞并分享,让更广大群体实现从HDF5文件中获益。

#创建新的数据框
df_ = pd.DataFrame(np.random.randn(5,5))
#导出到已存在的h5文件中,这里需要指定key
df_.to_hdf(path_or_buf='demo.h5',key='df_')
#创建于本地demo.h5进行IO连接的store对象
store = pd.HDFStore('demo.h5')
#查看指定h5对象中的所有键
print(store.keys())

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